基本的世界设定、主要人设和主角穿越产生影响之前的剧情主线肯定不变，但小说毕竟跟漫画不同，不可能完全忽视逻辑。为了避免逻辑bug，原著中的剧情和设定在本书中会有一定的改动，也就是说，本书里面所写的基于海贼王漫画重构的现实世界，是现实世界，会饿死累死烫死冻死窒息死的现实世界，不是那个不能带脑子看的少年漫里的世界。
改动主要有这么几点：
包括各国人口在内的一切会导致世界设定无法自洽的不合理数据都进行了合理化调整，比如鱼人岛人口由500万砍到了5万（海深1万米的限制摆在那里，方圆不过几千米，也就一个城镇的规模，500万人怎么可能塞得下。），佐乌也减到了3000多（空间一样受限，还是森林环境更加稀疏。），这样空间上才住得下，同时也符合鱼人跟毛皮族个体强但族群弱的基本定位；
阿拉巴斯坦的人口减少到了100万左右，因为按原著设定的1000万人口和沙漠国家的环境，这个国家面积会大到几乎完全堵死伟大航路，而七条路线之间没有重叠却是原著的核心设定，两者矛盾无法调和，只能优先保证核心设定，不砍人口不行；
而海军伟大航路支部的常