在胡亥手上，李斯招供之后，胡亥必然派人前来复审。如果李斯到时候突然翻供，拒不承认谋反，虽说李斯未必一定能因此而咸鱼翻生，但至少也将给赵高平添无数麻烦。
所以，赵高必须彻底打消李斯翻供的念头。于是，赵高按照条件反射的法则，对李斯进行了科学的调教。
赵高找来一位门下宾客，命其假扮胡亥派来的御史，前去复审李斯。假御史到得监狱，支开旁人，对李斯说道，“臣奉陛下之命前来，此间无人，丞相如有冤屈，尽可以实相告。”
自从入狱以来，这是李斯听到的第一句温暖的、有人味的话。李斯激动得热泪盈眶，胡亥终于派人来了。长久的刑罚已经让李斯变得脆弱，变得轻信，他根本就没有怀疑眼前这人的身份可能有假，而是将他当作一根救命稻草，牢牢抓住，再也不肯放手。
李斯执假御史之手，大哭道，“请君一定要转告陛下，李斯是冤枉的，李斯是忠臣啊！”又细诉自己对帝国的功勋和赤诚。假御史并不留心去听，只是偶尔嗯上一声，聊作应付。
假御史前脚离去，狱卒后脚进来，对李斯劈头就是一顿乱棍，边打边训斥道，“叫你胆敢翻供，叫你胆敢翻供！”
李斯吃痛不过，只能抱头求饶，道，“别再打了，我再也不翻供了。”
赵高仍不放心，再派一位宾客假扮谒者，谎称奉胡亥之命，复审李斯。李斯犹不醒悟，又在假谒者面前自诉冤枉。李斯激愤不已，泪尽而泣之以血。假谒者见状心中恻然，却也爱莫能助。
假谒者一出，狱卒再次进来，对李斯又是一阵狠揍。
就这样，赵高先后派了近十拨人，冒充胡亥的使者来试探李斯。李斯不辨真伪，每每翻供，自陈冤情。随后，照例要挨上一顿棍棒或鞭挞。
像巴甫洛夫著名的实验那样，李斯也形成了这样的条件反射：只要他一翻供，就必然要遭受毒打。他实在是不想再挨打了，他实在是宁愿死。
假作真来真亦假。等到胡亥真的派人前来复审之时，李斯再也不敢相信眼前这人真是胡亥的使者，他只是一味地重复道，“我有罪，我欲反。”
使者回报胡亥，胡亥不仅不会想到是赵高在暗中下了手脚，反而对赵高大赞道：“如无赵君，几为丞相所卖。”
不久之后，胡亥派往三川搜集李由通敌证据的使者也回到了咸阳。对李斯来说，使者带回来了一个好消息和一个坏消息，而这好消息和坏消息，其实又是同一个消息——李由在前方英勇抗敌，虽寡不敌众，也拒不投降，最终为项羽和刘邦的联军所破，死于曹参之手。
老年丧子，自然是再坏不过的消息。然而，李由在前线顽强战斗，为国捐躯，堪称帝国的英雄，关于他通敌的指控自然也就不攻自破。李由以他的壮烈牺牲，证明了李斯全家的无罪，却也算得上是好消息了。
可惜的是，李由的牺牲，依然无法拯救他全家的命运。此时的朝廷之中，赵高已经一手遮天，无所不能。日后他可以指鹿为马，现在他也能颠倒黑白。在赵高的威逼利诱之下，使者也只得捏造事实，上奏胡亥道，“李由通敌，确有其事。”
至此，胡亥对李斯谋反一事再无任何疑心，于是命赵高为李斯量刑。
赵高奏道，“李斯位居三公，不思报国尽忠，而起不臣之心。人臣之罪，莫过于此，非重惩不足以安天下，镇万民。判曰：李斯具五刑，诛三族。”
具五刑，按《汉书·刑法志》，具体内容为“先黥，劓，斩左右趾，笞杀之，枭其首，菹其骨肉于市。其诽谤詈诅者，又先断舌。”即便是在严酷的秦法之中，具五刑也称得上是最残忍的一种刑罚。
胡亥接奏，喟然叹道，“李斯侍奉先帝数十年，于我秦立有大功，此天下共睹，不容忘却。如无李斯，朕也不能有今日人主之尊。知恩不报，非人也。量刑如此之重，朕心实不忍。”
赵高面白如纸，满心惶恐，听胡亥这意思，莫非他要宽恕李斯，饶李斯不死？果真如此，那可就全完了。胡亥一句话，就可以让他在审判李斯时所使的种种伎俩，全变成了白费心机。李斯已经明白过来，都是赵高在设计陷害他，一旦李斯死里逃生，全力反扑，他赵高又将如何抵挡？
赵高搜肠刮肚，酝酿着自己的说辞，准备劝谏胡亥维持原判，胡亥却已接着说道，“改具五刑为腰斩，其余如君所奏。”
赵高大喜，恨不能抱住胡亥，娇声嗔道，“你早说嘛，害得人家的小心肝噗噗地跳。”
总之，无论是具五刑还是腰斩，李斯终究还是一死，而且同样死得毫无体面可言。或许，在胡亥眼中，将具五刑改成腰斩，虽然是换汤不换药，却已经是他仁慈的最大限度了。
3、最后的时刻
李斯行刑的日子到了，时为秦二世三年十月，即公元前208年十月。
（注：关于李斯死亡的月份，《史记·李斯列传》云：“二世二年七月，具（李）斯五刑，论腰斩咸阳市。”然而，李斯之死，当在李由之后无疑。考《史记·秦楚之际月表》，李由之死，在二世二年八月。又《史记·秦始皇本纪》云，“（二世三年）冬，赵高为丞相，竟案李斯杀之。”可知李斯定刑或在七月，而实际执行则在初冬。）
监刑官来提李斯，问道，“丞相临去，可有什么遗言？”
李斯自知死期已到，叹道，“事已至此，夫复何言？”
监刑官道，“人死如灯灭。灯灭而光消，虽欲言而不能也。丞相治国三十余年，今日将死，得无一言以遗君国乎？”
李斯仰天长叹道：“嗟乎，悲夫！不道之君，何可为计哉！昔者桀杀关龙逢，纣杀王子比干，吴王夫差杀伍子胥。此三臣者，岂不忠哉，然而不免于死，身死而所忠者非也。今吾智不及三子，而二世之无道过于桀、纣、夫差，吾以忠死，宜矣。且二世之治岂不乱哉！日者夷其兄弟而自立也，杀忠臣而贵贱人，作为阿房之宫，赋敛天下。吾非不谏也，而不吾听也。凡古圣王，饮食有节，车器有数，宫室有度，出令造事，加费而无益于民利者禁，故能长久治安。今行逆于昆弟，不顾其咎；侵杀忠臣，不思其殃；大为宫室，厚赋天下，不爱其费：三者已行，天下不听。今反者已有天下之半矣，而心尚未寤也，而以赵高为佐，吾必见寇至咸阳，麋鹿游于朝也。”
李斯这段遗言，既是逆耳的忠言，也是清醒的预言。监刑官命人记下，然后一